Generell ist das Layout des ASUS Maximus IV Gene-Z gut durchdacht. Einmal mehr praktisch sind beispielsweise die gewinkelten SATA-Anschlüsse sowie die Power- und Reset-Buttons. Das Maximus IV Gene-Z wurder sogar mit einer Debug-Anzeige ausgestattet. Auch bei der Platzierung der PCI-Express x16 Slots gibt man sich bei ASUS keine Blösse und blockiert mit dem zweiten Slot die Anschlüsse an der unteren Kante des Boards nicht. Einzig die DIMM-Slots sind unter Umständen etwas nahe am CPU Sockel, so dass es eventuell zu Komplikationen mit grossen Tower-Kühlern kommen kann. Die Kühlelemente auf den Spannungswandlern hingegen sind nicht zu gross geraten und lassen ausreichend Freiraum, so dass Kühler komfortabel installiert werden können.